Je ne suis pas électricien mais j'aurais dit une sensibilité dans ton installation électrique de ta maison, est que la Fender serait plus sensible que la Yamaha qui est peut-être mieux configuré au niveau du blindage électrique.
Essaie peut-être d'abord en branchant ton matos dans une autre pièce, si possible sur un circuit électrique différent ou ailleurs que chez toi (chez un pote, salle de répète ) avec ton propre matos: ampli, les deux basses, même allonge électrique ou multiprise etc...
Elimine au fur et à mesure les possibilités : changement de d'allonge ou multiprise, changement de jack,etc...
si ça fait pareil partout , c'est que ça vient de la basse je dirais.